Все гончие по кровяному следу произошли от примитивных охотничьих собак. Чтобы улучшить качества породы, селекционеры провели скрещивания с местными горными гончими, а также с ганноверскими и тирольскими гончими. Клуб баварской горной гончей был основан в 1912 г. В настоящее время эта порода встречается редко.

Порода происходит от крупных кровяных гончих средних веков, к числу которых относилась и гончая св. Губерта. Она выведена в XVII веке. В конце XIX века селекционеры улучшили качества этой породы путем скрещивания ее с более легкими гончими. Ганноверская гончая в настоящее время встречается редко.